繼 2001 年人類基因組計(jì)劃完成之后,“國(guó)際單倍體型(HapMap)計(jì)劃”和“千人基因組計(jì)劃”相繼開展并積累了海量的遺傳變異數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)為更深層次上了解種族之間、個(gè)體之間的基因差異,以及為各種疾病的關(guān)聯(lián)分析提供了詳細(xì)的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
隨著人類遺傳學(xué)的深入研究,科學(xué)家發(fā)現(xiàn),基因遺傳并不能解釋所有表型或疾病的發(fā)生,例如 II 型糖尿病、癌癥以及心血管疾病等,這些疾病一般都是在遺傳與環(huán)境的共同作用下發(fā)生,例如肺癌與吸煙有著密不可分的關(guān)系,肥胖也可能是因?yàn)槟c道微生物的影響,至此,人類遺傳學(xué)的研究范疇被大大拓寬,廣泛的涵蓋了人類遷徙、進(jìn)化、疾病、藥物、發(fā)育、環(huán)境、腸道微生物等各個(gè)領(lǐng)域。
華大基因通過(guò)多平臺(tái)的測(cè)序技術(shù)在 DNA 水平、RNA 水平、表觀遺傳學(xué)水平以及宏基因組水平對(duì)疾病展開全方位的研究,并結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)開展蛋白質(zhì)組水平的研究,甚至是利用各組學(xué)平臺(tái)進(jìn)行貫穿研究,由此得出的海量數(shù)據(jù),與表型相關(guān)的各種信息(所處環(huán)境、年齡、疾病治療史、家族史、易感性等)相結(jié)合,為全面揭示人類遺傳學(xué)機(jī)制奠定了重要基礎(chǔ)。除此之外,華大基因在新技術(shù)、新的研究熱點(diǎn)領(lǐng)域也都有涉足,例如單細(xì)胞研究、免疫組庫(kù)研究、液體活檢等。
華大基因擁有多種平臺(tái),可以在 DNA 水平、RNA 水平、表觀遺傳學(xué)等各個(gè)水平對(duì)動(dòng)植物各種感興趣表型性狀進(jìn)行全方位研究,并結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)開展蛋白質(zhì)組水平的研究,利用貫穿組學(xué)深度解析動(dòng)植物界的科學(xué)問(wèn)題,檢測(cè)與人類息息相關(guān)的農(nóng)藝性狀相關(guān)基因、研究動(dòng)植物進(jìn)化、抗病、抗逆、生殖發(fā)育等生理機(jī)制,為育種挖掘多樣性的遺傳資源,為提高動(dòng)植物育種進(jìn)程奠定堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)。服務(wù)內(nèi)容如下:
華大基因具備基因組從頭測(cè)序、重測(cè)序、簡(jiǎn)化基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、甲基化研究、組蛋白修飾、蛋白定量和定性研究等服務(wù)的能力。
微生物研究方向涉及人類生產(chǎn)生活的方方面面,在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,有病原菌 / 耐藥菌及腸道菌群的研究,農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,動(dòng)植物致病菌和耐藥菌與農(nóng)業(yè)生產(chǎn)方面的研究;工業(yè)領(lǐng)域,工業(yè)微生物或工業(yè)菌、工業(yè)生產(chǎn)環(huán)境等微生物群落研究。研究對(duì)象包括從個(gè)體到群落的研究,產(chǎn)品涉及基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白的各個(gè)水平,包括細(xì)菌 / 真菌的 de novo 測(cè)序、重測(cè)序、16S/18S/ITS 擴(kuò)增子測(cè)序、宏基因組研究,以及與微生物相關(guān)的蛋白方面的研究等。
華大基因在微生物領(lǐng)域的研究實(shí)力雄厚,啟動(dòng)或參與了多個(gè)大型的微生物研究計(jì)劃,包括萬(wàn)種微生物基因組計(jì)劃、人體腸道微生物宏基因組研究計(jì)劃(MetaHIT)、百萬(wàn)微生態(tài)基因組計(jì)劃和地球環(huán)境微生物計(jì)劃(EMP)。目前已完成超過(guò) 10 萬(wàn)例樣本,累積發(fā)表文章 500 多篇,累積影響因子超過(guò) 3000。